Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKD1Q969G9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms