Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms