Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCAMP4Q969E2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms