Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TOPBP1Q92547 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOPBP1Q92547 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms