Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SELENOMQ8WWX9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms