Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX33Q8WV41 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms