Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC12Q8WUD4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC12Q8WUD4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms