Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFA0

USP32, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32, humanhuman

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP32Q8NFA0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP32Q8NFA0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP32Q8NFA0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP32Q8NFA0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP32Q8NFA0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP32Q8NFA0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP32Q8NFA0 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP32Q8NFA0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP32Q8NFA0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP32Q8NFA0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP32Q8NFA0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP32Q8NFA0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP32Q8NFA0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP32Q8NFA0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP32Q8NFA0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms