Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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ZNF548Q8NEK5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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ZNF548Q8NEK5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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ZNF548Q8NEK5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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ZNF548Q8NEK5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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ZNF548Q8NEK5 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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ZNF548Q8NEK5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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ZNF548Q8NEK5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF548Q8NEK5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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