Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRRC17Q8N6Y2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms