Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms