Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CLDN19Q8N6F1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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