Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1N4

KRT78, Keratin, type II cytoskeletal 78, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT78Q8N1N4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRT78Q8N1N4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT78Q8N1N4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms