Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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C9orf40Q8IXQ3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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C9orf40Q8IXQ3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf40Q8IXQ3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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C9orf40Q8IXQ3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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C9orf40Q8IXQ3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C9orf40Q8IXQ3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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