Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME9Q86XW9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME9Q86XW9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms