Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APTXQ7Z2E3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APTXQ7Z2E3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms