Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HECW1Q76N89 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HECW1Q76N89 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms