Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPN5Q6U736 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms