Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MED27Q6P2C8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED27Q6P2C8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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