Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMBOX1Q6NT76 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms