Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIGD3Q6B0B8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms