Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms