Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms