Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL38Q2WGJ6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms