Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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LAMA3Q16787 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAMA3Q16787 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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