Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDKN3Q16667 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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