Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NRF1Q16656 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms