Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDK4Q16654 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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