Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NEDD8Q15843 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8Q15843 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms