Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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