Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
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NCOA1Q15788 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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NCOA1Q15788 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
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NCOA1Q15788 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
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NCOA1Q15788 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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NCOA1Q15788 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCOA1Q15788 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
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