Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ALX1Q15699 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ALX1Q15699 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms