Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SYCP1Q15431 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SYCP1Q15431 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SYCP1Q15431 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SYCP1Q15431 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SYCP1Q15431 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SYCP1Q15431 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SYCP1Q15431 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYCP1Q15431 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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