Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TNIP1Q15025 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNIP1Q15025 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms