Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCLAFQ15004 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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