Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms