Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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EBI3Q14213 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EBI3Q14213 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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