Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFR3AQ14156 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms