Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBFBQ13951 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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