Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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