Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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