Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CUL3Q13618 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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