Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C1orf61Q13536 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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