Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SGCGQ13326 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SGCGQ13326 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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