Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CHAF1BQ13112 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CHAF1BQ13112 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHAF1BQ13112 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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