Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
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PRDM2Q13029 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
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PRDM2Q13029 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRDM2Q13029 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
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PRDM2Q13029 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
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PRDM2Q13029 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
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PRDM2Q13029 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM2Q13029 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM2Q13029 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
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PRDM2Q13029 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
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PRDM2Q13029 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM2Q13029 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM2Q13029 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM2Q13029 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM2Q13029 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM2Q13029 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM2Q13029 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRDM2Q13029 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM2Q13029 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM2Q13029 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM2Q13029 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRDM2Q13029 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM2Q13029 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM2Q13029 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM2Q13029 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM2Q13029 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM2Q13029 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM2Q13029 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM2Q13029 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRDM2Q13029 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM2Q13029 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM2Q13029 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM2Q13029 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRDM2Q13029 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
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