Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
BNIP1Q12981 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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