Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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KCNMA1Q12791 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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KCNMA1Q12791 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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