Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP4Q09028 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms