Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSRP1Q08945 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms